Сенашова Мария Юрьевна

Институт вычислительного моделирования СО РАН

Рассмотрено пространственное распределение значений GC-состава фрагментов геномов хлоропластов и митохондрий. Под пространственным распределением понимается распределение точек, соответствующих участкам геномов, в пространстве частот триплетов. Обнаружено, что значения GC-состава фрагментов для большинства геномов распределены не хаотически, а упорядоченно. Были обнаружены 2 основных типа распределения: градиентное и центрально-симметричное. У геномов хлоропластов встречается только градиентное распределение. У митохондрий встречаются оба типа распределения. Тип распределения для митохондрий зависит от вида организма. Пространственное распределение GC-состава является устойчивым относительно изменения длины окна считывания.

порядок, пространственное распределение, триплеты, частотные словари, главные компоненты